پژوهشگران دانشگاه راکفلر با استخراج مستقیم DNA از خاک و بازسازی ژنوم باکتریهای ناشناخته، دو آنتیبیوتیک جدید شناسایی کردند که علیه گونههای مقاوم نیز مؤثرند؛ کشفی که در Nature Biotechnology منتشر شده است.
به گزارش پایگاه خبری تحلیلی اعتماد نو، تیمی به سرپرستی «شان اف. بریدی» در دانشگاه راکفلر روشی نوین برای مطالعه باکتریهایی که قابل کشت در آزمایشگاه نیستند توسعه داده است. این رویکرد شامل استخراج قطعات بزرگ DNA از خاک، بازسازی ژنوم صدها باکتری ناشناخته و پیشبینی ساختار مولکولهای طبیعی با بهرهگیری از فناوری synBNP است.
در این پژوهش، دادههای ژنتیکی به کمک تحلیل رایانهای و سنتز شیمیایی به ترکیبات واقعی تبدیل شد. تنها از یک نمونه خاک جنگلی، صدها ژنوم کامل باکتری شناسایی و دو آنتیبیوتیک تازه به دست آمد: «اِروتاسیدین» که غشای باکتریها را تخریب میکند و در برابر گونههای مقاوم نیز کارایی دارد، و «تریجینتامایسین» که بر یک موتور پروتئینی نادر اثر میگذارد.
این روش که بدون نیاز به کشت میکروبها، امکان کشف ترکیبات زیستی جدید را فراهم میآورد، قابل استفاده در محیطهای گوناگون است و میتواند نسل تازهای از آنتیبیوتیکها و شناخت عمیقتر روابط میکروبی در طبیعت را به ارمغان بیاورد.
